Década de 1941 a 1951

Año de 1941

El 19 de octubre LDA, con victoria de 2 por 1 ante el Orión y a falta de una fecha para la finalización del torneo, obtiene en forma invicta el tercer título del club; los tantos los marcó José Luis "Chime" Rojas. El campeonato se jugó a una vuelta, ya que la Federación tenía previsto que los equipos llevaran a cabo una temporada internacional. El cuadro alajuelense ganó los 6 encuentros ante Gimnástica, Universidad, La Libertad, Cartaginés, Orión y Herediano, anotando 19 goles y recibiendo 7 para sumar un total de 12 unidades.

Año de 1942

18 de enero de 1942: Se inaugura el Estadio de Alajuela, cuando LDA recibe al Cartaginés. La gradería de madera que se colocó en el reducto rojinegro provenía del Estadio Nacional. Se cobró 25 centavos a los hombres y 10 centavos a las mujeres.

Año de 1943

Un punto separó a LDA de obtener el Campeonato, cuando marchó invicto a lo largo del certamen y a falta tres juegos, un empate bastaba para salir campeón. Esos tres encuentros finales se perdieron ante la Libertad, Universidad y Orión.

Año de 1944

No se participa en el Campeonato Nacional de Primera División, ya que se planeó efectuar una temporada en Colombia. La Federación no otorgó el permiso. Además un castigo impuesto a Alejandro Morera Soto motivó a los dirigentes alajuelenses a no tomar parte de ese certamen en señal de protesta. Luego de los arreglos que se dieron, los alajuelenses toman parte del certamen y finalizan en la segunda posición.

Año de 1946

El 22 de junio de 1946: LDA, con la victoria de 5 goles por 3 ante la Gimnástica, logró el campeonato nacional de 1945, el cuarto en la historia del club, tras un año de ausencia en el certamen local.

Año de 1949

12 de octubre 1949: El Estadio Nacional fue el escenario del primer clásico nacional entre LDA vs Deportivo Saprissa, con victoria liguista de 6 goles por 5.

Año de 1950

28 de mayo 1950: En el Estadio Nacional, LDA culminó la temporada de 1949, logrando el quinto campeonato nacional, con una diferencia de un punto sobre el segundo lugar, la Gimnástica Española.

23 de julio 1950: Partido internacional memorable. LDA enfrenta al conjunto italiano del Génova, que no encontró respuesta para frenar el juego liguista pues salió derrotado 6 goles por 0.

Alajuelense 6: Carlos Alvarado, Nelson Morera, "Vivo" Quesada, "Catato" Cordero, Héctor Julio González, Elías Valenciano, "Farachin" Alvarado, Alvaro Murillo, Óscar Mórux, "Chumpi" Zeledón y José Manuel "Indio" Retana. D.T. Salvador Soto y Chime Rojas.

Génova 0: Gualizzi, Pellicari, Bergattina, Tartorolo, Odone, Bergamo, Koening, Aballay, Danta, Fementine y Magni.

Goles LDA: Alvaro Murillo, Elías Valenciano, Mórux, "Chumpis" Zeledón, Alvaro Murillo.

26 de noviembre 1950: El clásico llega a la ciudad de Alajuela, el Estadio de LDA estaba en pleno desarrollo. Un encuentro difícil y batallador, donde los locales sacan el triunfo de 3 goles por 2.

25 de diciembre 1950: El Boca Juniors de Argentina visitó Costa Rica para enfrentar a Liga Deportiva Alajuelense en el Estadio Nacional. El partido terminó con empate a un tanto donde resaltó la figura del portero liguista Carlos Alvarado quien inició los pasos para constituirse en el mejor portero del fútbol de Costa Rica.

Boca Juniors 1: Diano, Colman, Otero, Moreno, Ferraro Castro, Búsico, Sosa, Nordelli, Pescia y Benítez.

Alajuelense 1: Carlos Alvarado, Nelson Morera, "Vivo" Quesada, "Catato" Cordero, Héctor Julio González Valenciano, "Farachín" Alvarado, Alvaro Murillo, Óscar Móruz, "Chumpis" Zeledón y José Manuel Retana. D.T. Salvador Soto y Chime Rojas.

Gol de LDA: "Chumpi" Zeledón.

Año de 1951

14 de enero 1951: Con una victoria de 2 goles por 1 ante el Orión, Liga Deportiva Alajuelense obtiene el cetro de 1950, al sumar un total de 26 puntos. Ese fue el primer bicampeonato en la historia de la Institución.